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7个步骤教你找到启动子

2021-05-12 来源:爱站旅游
导读7个步骤教你找到启动子


经验 | 7个步骤教你找到启动子 2015-11-14 解螺旋 解螺旋

师弟对着电脑上的一大串序列发呆,小鱼问道,“师弟,你这是在格物致知吗?”

“没有啦,我在想怎么把这个基因启动子找出来。”

“试试用Map viewer吧!”

下面小鱼就以人的K-RAS基因为例讲述一下找基因启动子序列的具体操作步骤:

1.

打开NCBI的Map viewer页面,

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/index.html

2.

点击“GO”出现如下页面:

3.出现下图,RAS参考序列给出了两个,序列有微小的差异,但总体来说基本相同。

现在普遍采用的是“reference”那个序列。

4.点击上述两条序列第一条序列(即12 reference)对应的“Genes seq”,出现新的

页面,点击下图出现的“Download/ViewSequence/Evidence ”,即可下载查看序列等功能。

5.出现的页面提示K-ras基因在染色体上的位置:

6.因为启动子一般在-2000~+200区域,把页面中的参数修改一下:

7.那么就得到K-ras的启动子区域,如下图:

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